Nella gara conclusiva del Trittico della Regione Lombardia, corsa di apertura dell'ultima settimana di in Italia, Geniez della ALM si è imposto in volata, raggiungendo Pinot e Nibali staccatisi dal gruppo. Nibali non è riuscito a vincere dopo il successo del 2015. Al secondo posto l'ex compagno di squadra del francese, il ciclista della FDJ Pinot. Da registrare una caduta in gruppo, al seguito della quale Reichenbach della FDJ si è dovuto ritirare.
Il gruppo è partito con un ritmo sostenuto, proseguendo a scatti senza che nessuno riesca a fare la differenza. Qualche allungo nelle fasi iniziali, ma subito neutralizzati. Il primo allungo importante è di Alessandro Tonelli (Bardiani-CSF), Artem Nych (Gazprom-RusVelo), Diego Rubio (Caja Rural-Seguros RGA), Adrian Turek (Israel Cycling Academy), Marco Bernardinetti (Amore & Vita) e Ettore Carlini (D’Amica-Utensilnord), inseguiti da Viel e poi dal resto del gruppone. La parte centrale della corsa vede un'alternanza di stacchi. A due giri dalla conclusione, la corsa, già bella e movimentata dal seguirsi di allunghi, vede cinque battistrada Turek, Rubio , Verona, Halilaj e Latour con alle spalle sei inseguitori divisi dal resto del gruppo. A 9 chilometri dalla fine il gruppo si ricompatta con Visconti a dettare il ritmo, seguito da Ulissi, Nibali e un terzetto della Cannondale-Dapac.Nell'ultimo chilometro, Geniez recupera su Nibali e Pinot (unico della FDJ a rimanere nei fuggitivi), seguito da Ulissi. Allo sprint finale, il francese dell'ALM è più rapido dei tre a taglia per primo il traguardo. Ottimo risultato per Nibali che ha rifiutato la convocazione al mondiale per recuperare dall'infortunio e prepararsi alla settimana delle corse di Ottorbe in Italia, le ultime per questa stagione.Undicesimo successo per uno straniero nella Tre Valli Varesina, corsa tipicamente segnata dal tricolore italiano, che in questa edizione vede primeggiare un altro tricolore, ma francese.