Sono 38 le squadre ammesse alla Fase Finale della Coppa Italia di Lega Pro 2016-17: 11 provenienti dalla Fase Eliminatoria, ovvero le compagini che hanno vinto i rispettivi gironi, mentre 27 quelle "retrocesse" dalla Tim Cup. Per stabilire la composizione del tabellone e le date delle gare del primo turno (ad eliminazione diretta in casa della squadra nominata per prima), bisognerà attendere venerdì prossimo 30 settembre, ovvero il giorno del sorteggio che sarà effettuato alle 11.30 nella sede della Lega Pro a Firenze.
Queste le 11 squadre ammesse dopo la Fase Eliminatoria:
Giana Erminio (girone A), Pro Piacenza (girone B), Venezia (girone C), Prato (girone D), Viterbese Castrense (girone E), Virtus Francavilla (girone F), Catania (girone G), Fano (girone H), Lupa Roma (girone I), Taranto (girone L), Vibonese (girone M).
Queste le 27 squadre provenienti dalla Tim Cup:
Alessandria, Ancona, Arezzo, Bassano Virtus, Carrarese, Casertana, Como, Cosenza, Cremonese, Feralpisalò, Fidelis Andria, Foggia, Juve Stabia, Lecce, Livorno, Maceratese, Matera, Messina, Modena, Padova, Pontedera, Pordenone, Reggiana, Robur Siena, Sudtirol, Teramo, Tuttocuoio.